Los resultados del estudio de algas invasoras publicados en Marine Pollution Bulletin

Nos alegra comunicar que los resultados de la comparación entre comunidades invadidas y no invadidas muestreadas en 2015 han sido publicados en la revista internacional Marine Pollution Bulletin

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En este artículo estudiamos el efecto que las algas invasoras tienen al nivel de comunidad, enfocándonos principalmente en los organismos de talla inferior (pequeño macrobentos y meiobentos), usando los genes 18S y COI y el procedimiento de separación por tallas y el procesado bioinformático desarrollado en METABARPARK. Este es el resumen del artículo:

En este artículo se analiza con metabarcoding de los genes 18S y COI los efectos de la proliferación de algas invasivas en comunidades marinas de sustrato duro de dos Parques Nacionales españoles. Las algas invasoras estudiadas son Caulerpa cylindracea, Lophocladia lallemandii y Asparagopsis armata. Se trata de formas recubrientes, dominadoras del paisaje, y el trabajo se enfoca particularmente en sus efectos en las comunidades de meiobentos y macrobentos que se desarrollan bajo la cobertura algal, separadas en dos clases de tamaño mediante tamices. Se presenta un nuevo tratamiento semicuantitativo de los datos de metabarcoding. Los resultados para ambos marcadores muestran que la presencia de algas invasoras tiene un efecto significante en las comunidades subyacentes en el caso de Lophocladia lallemandii y Asparagopsis armata, pero no para Caulerpa cylindracea. Además, cambios en riqueza de MOTUs y en diversidad en función de la presencia o no de algas invasoras varían en magnitud y dirección dependiendo del alga considerada. Estos resultados muestran que el metabarcoding permite monitorizar los efectos menos conspicuos, pero no menos importantes, de la presencia de algas invasoras dominantes.

Imágenes de las comunidades analizadas, con (izquierda) y sin (derecha) algas invasoras. A,B: comunidad esciáfila en Cabrera con y sin Caulerpa cylindracea; C,D: comunidad fotófila en Cabrera con y sin Lophocladia lallemandii; E,F: comunidad fotófila en Islas Cíes con y sin Asparagopsis armata. Foto A de Eneko Aspillaga; fotos C,D de Pol Capdevila; foto E de Enric Ballesteros; fotos B,F de los autores

Los resultados de los muestreos publicados en PeerJ Preprints

Mientras el artículo está en el proceso de revisión por pares, hemos publicado el manuscrito en formato Pre-print en el  repositorio PeerJ Preprints, donde está libremente accesible en https://peerj.com/preprints/3429/

METABARCODING LITTORAL HARD-BOTTOM COMMUNITIES: UNEXPECTED DIVERSITY AND DATABASE GAPS REVEALED BY TWO MOLECULAR MARKERS
Wangensteen OS, Palacín C, Guardiola M, Turon X (2017) PeerJ Preprints 5:e3429v1

En este manuscrito reportamos la ingente biodiversidad encontrada en las comunidades de Islas Cíes y Cabrera. Discutimos diversos aspectos técnicos, comparamos los dos genes estudiados (18S y COI), y realizamos análisis ecológicos. Este es el abstract del artículo:


Se desarrolla en este trabajo un método basado en metabarcoding para caracterizar la biodiversidad de comunidades naturales estructuralmente complejas en fondos duros. Se usan nuevos cebadores para dos marcadores moleculares: el "fragmento Leray" del gen mitocondrial citocromo oxidasa I, y la región v7 del gen ribosomal ARN 18S. Se analizan ocho comunidades bentónicas litorales de dos Parques Nacionales en España (uno en el Océano Atlántico y otro en el Mar Mediterráneo). Las muestras fueron tamizadas en tres fracciones de tamaño de las que el ADN se extrajo separadamente.
Se usaron análisis de agrupamiento bayesiano para delimitar las unidades taxonómicas operativas moleculares (MOTUs) y se compilaron bases de datos de referencia para la asignación taxonómica. Encontramos valores inesperadamente altos de riqueza de MOTUs, que sugieren que estas comunidades albergan una gran cantidad de biodiversidad de eucariotas aún no descrita. Se encuentran aún lagunas significativas en las bases de datos de referencia, que actualmente impiden la asignación taxonómica completa de las secuencias detectadas. Sin embargo, más del 90% (en abundancia) de las secuencias han podido ser asignadas a tipo o inferior nivel taxonómico. La tasa de identificación probablemente mejorará de forma sustancial en el futuro, conforme las bases de datos se vayan actualizando. Nuestros resultados muestran que el metabarcoding en medio marino, actualmente aplicado principalmente a plancton o sedimentos, puede ser adaptado a comunidades estructuralmente complejas de fondo duro. Se demuestra que es un método robusto, rápido, objetivo y asequible para una caracterización integral de comunidades bentónicas dominadas por macrófitos y metazoos modulares o coloniales, permitiendo una biomonitorización estandarizada de estas comunidades. Los nuevos cebadores universales para COI pueden ser potencialmente usados para caracterizar la biodiversidad con alta resolución taxonómica en un amplio abanico de comunidades eucariotas marinas, terrestres, o de agua dulce.

Porcentaje de MOTUs de las principales categorías de organismos encontrado en las tres fracciones estudiadas (A, B, C) con 18S (arriba) o COI (abajo) en todas las comunidades estudiadas.